Udtømningsbehandlingen er en højdosisbehandling, hvor formålet er at tømme tarmen for hård og gammel afføring. Der kan gå op til 24 timer, efter barnet har taget medicinen, til I ser en effekt. Børnene kan i forbindelse med udtømningen få mavekneb. Mavesmerterne forsvinder i takt med, at de hårde afføringsknolde blødgøres.
Det er vigtigt, at udtømningsbehandlingen fortsætter, indtil der er sikkerhed for, at barnet er helt udtømt. Barnet er helt udtømt:
Er du i tvivl, bør du fortsætte et døgn mere med udtømning. Mangelfuld udtømning giver et dårligt behandlingsresultat, når man går over til vedligeholdelsesbehandling. Umiddelbart efter at udtømningsbehandlingen er startet, kan der forekomme tynd afføring. Den tynde afføring skal ikke give anledning til at reducere i macrogol eller macrogol junior dosis.
Nedenfor findes vejledende dosering af macrogol og macrogol junior til udtømning af børn mellem henholdsvis 2-11 år og 12-16 år. Der kan eventuelt rundes op til nærmeste hele brev.
Udtømning 2-11 år:
| Vægt i kg. | Antal breve macrogol junior | Antal breve macrogol |
| 10 – 13 kg. | 3 breve | 1,5 brev |
| 14 – 19 kg. | 4 breve | 2,0 breve |
| 20 – 24 kg. | 5 breve | 2,5 breve |
| 25 – 28 kg. | 6 breve | 3,0 breve |
| 29 – 30 kg. | 7 breve | 3,5 breve |
| 31 – 36 kg. | 8 breve | 4,0 breve |
| 37 – 41 kg. | 9 breve | 4,5 breve |
| 42 – 45 kg. | 10 breve | 5,0 breve |
| 46 – 49 kg. | 11 breve | 5,5 breve |
| 50 kg. og derover | 12 breve | 6,0 breve |
Udtømning 12-16 år:
| Vægt i kg. | Antal breve macrogol |
| 20 – 29 kg. | 3 breve |
| 30 – 39 kg. | 4 breve |
| 40 – 47 kg. | 5 breve |
| 48 – 55 kg. | 6 breve |
| 56 – 59 kg. | 7 breve |
| 60 kg. og derover | 8 breve |